Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
APOFQ13790 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
APOFQ13790 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
APOFQ13790 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
APOFQ13790 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
APOFQ13790 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
APOFQ13790 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
APOFQ13790 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
APOFQ13790 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
APOFQ13790 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
APOFQ13790 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
APOFQ13790 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
APOFQ13790 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
APOFQ13790 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
APOFQ13790 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
APOFQ13790 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
APOFQ13790 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
APOFQ13790 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
APOFQ13790 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
APOFQ13790 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
APOFQ13790 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
APOFQ13790 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
APOFQ13790 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
APOFQ13790 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
APOFQ13790 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
APOFQ13790 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.72□□□□□ -2.52
APOFQ13790 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
APOFQ13790 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
APOFQ13790 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.73□□□□□ -2.53
APOFQ13790 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
APOFQ13790 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
APOFQ13790 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
APOFQ13790 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
APOFQ13790 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
APOFQ13790 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
APOFQ13790 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
APOFQ13790 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
APOFQ13790 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
APOFQ13790 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
APOFQ13790 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
APOFQ13790 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
APOFQ13790 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
APOFQ13790 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
APOFQ13790 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
APOFQ13790 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
APOFQ13790 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
APOFQ13790 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
APOFQ13790 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
APOFQ13790 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
APOFQ13790 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
APOFQ13790 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
APOFQ13790 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
APOFQ13790 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
APOFQ13790 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
APOFQ13790 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
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APOFQ13790 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
APOFQ13790 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
APOFQ13790 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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APOFQ13790 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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APOFQ13790 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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APOFQ13790 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
APOFQ13790 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
APOFQ13790 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
APOFQ13790 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
APOFQ13790 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
APOFQ13790 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
APOFQ13790 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
APOFQ13790 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
APOFQ13790 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
APOFQ13790 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
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