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Protein–RNA interactions for Protein: Q13616
CUL1, Cullin-1, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL1
Q13616
Y_RNA.299-201
ENST00000364973
94 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
CUL1
Q13616
RNU6-716P-201
ENST00000365621
103 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
CUL1
Q13616
MIR501-201
ENST00000390204
84 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
CUL1
Q13616
RNU6-269P-201
ENST00000391077
97 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
CUL1
Q13616
AC108059.2-201
ENST00000434626
151 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
CUL1
Q13616
AC107027.2-201
ENST00000512197
115 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
CUL1
Q13616
RNU7-129P-201
ENST00000516128
62 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
CUL1
Q13616
MIR3646-201
ENST00000578301
84 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
CUL1
Q13616
MIR548AD-201
ENST00000584780
82 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
CUL1
Q13616
Clostridiales-1.4-201
ENST00000636807
150 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
CUL1
Q13616
Y_RNA.49-201
ENST00000362714
112 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.65-201
ENST00000362846
100 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU6-818P-201
ENST00000364837
108 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU6-449P-201
ENST00000383914
107 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU6-1023P-201
ENST00000516137
106 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU6-1232P-201
ENST00000516299
86 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU2-60P-201
ENST00000517290
128 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
U7.6-201
ENST00000610841
64 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR1295B-201
ENST00000636144
60 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
AC073869.9-201
ENST00000641610
120 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNA5SP325-201
ENST00000363756
130 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.337-201
ENST00000365312
102 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.459-201
ENST00000384251
102 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.497-201
ENST00000384447
98 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR519A1-201
ENST00000385257
85 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR643-201
ENST00000385267
97 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU4-69P-201
ENST00000410677
143 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
AC097635.1-201
ENST00000450678
155 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
AC138907.4-201
ENST00000570107
226 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
uc_338.28-201
ENST00000612082
187 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR499B-201
ENST00000636498
73 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
SNORA32.1-201
ENST00000364514
115 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR568-201
ENST00000385036
95 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR1302-3-201
ENST00000408128
138 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
AC021443.1-201
ENST00000604478
211 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
AC105081.1-201
ENST00000617727
106 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU6-652P-201
ENST00000365488
107 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU6-1321P-201
ENST00000390905
107 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
AC104692.1-201
ENST00000472406
90 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU7-123P-201
ENST00000515911
60 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU6-240P-201
ENST00000516098
97 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNA5SP330-201
ENST00000517096
96 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
EBAG9-207
ENST00000531677
777 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
AC062037.2-201
ENST00000610137
73 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
SNORA70.25-201
ENST00000612741
95 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
AC067863.3-201
ENST00000624172
122 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU6-756P-201
ENST00000383997
107 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR593-201
ENST00000384856
100 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR548I2-201
ENST00000408348
149 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.793-201
ENST00000411222
111 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU7-165P-201
ENST00000458864
60 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU7-164P-201
ENST00000459221
62 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU7-104P-201
ENST00000459398
79 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNA5SP480-201
ENST00000516840
109 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR3128-201
ENST00000581957
66 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.477-201
ENST00000384352
108 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR206-201
ENST00000384872
86 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR548L-201
ENST00000408303
86 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU7-48P-201
ENST00000458875
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BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU7-159P-201
ENST00000459284
62 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.680-201
ENST00000516441
93 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR2909-201
ENST00000617113
69 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.60-201
ENST00000362831
98 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.200-201
ENST00000364018
102 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.205-201
ENST00000364128
113 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.298-201
ENST00000364960
107 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.540-201
ENST00000384638
111 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR635-201
ENST00000384830
98 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.651-201
ENST00000459380
103 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
TRAJ51-201
ENST00000504127
63 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU6-1265P-201
ENST00000516342
103 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU7-121P-201
ENST00000516604
62 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
RNU6-111P-201
ENST00000517179
105 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR4677-201
ENST00000584153
80 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
MIR7111-201
ENST00000619751
72 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
CUL1
Q13616
Y_RNA.98-201
ENST00000363109
102 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
RNU6-1020P-201
ENST00000363684
107 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
RNU6-302P-201
ENST00000365249
107 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
MIR599-201
ENST00000385069
95 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
AC009779.6-201
ENST00000603972
165 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
AP001362.1-201
ENST00000625165
124 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
MIR6844-201
ENST00000637122
62 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
Y_RNA.83-201
ENST00000363005
113 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
Y_RNA.127-201
ENST00000363386
109 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
Y_RNA.233-201
ENST00000364407
101 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
RNU6-47P-201
ENST00000383866
107 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
Y_RNA.448-201
ENST00000384185
108 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
RNU6-929P-201
ENST00000384429
107 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
RNU6-1011P-201
ENST00000384668
107 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
RNU6-239P-201
ENST00000390990
99 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
SNORD77B-201
ENST00000391112
67 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
AL603914.1-201
ENST00000401964
204 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
AC103879.1-201
ENST00000503093
255 nt
TSL 2
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
RNU6-1219P-201
ENST00000516143
112 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
RNU6-180P-201
ENST00000516697
61 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
RNU6ATAC22P-201
ENST00000516794
89 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
SNORA20.1-201
ENST00000364790
130 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
Y_RNA.447-201
ENST00000384184
113 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
U4.1-201
ENST00000620349
87 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
CUL1
Q13616
RNU4-84P-201
ENST00000364200
139 nt
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
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