Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NAE1Q13564 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NAE1Q13564 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NAE1Q13564 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.6 ms