Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RIPK1Q13546 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.3 ms