Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUBB3Q13509 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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TUBB3Q13509 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
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TUBB3Q13509 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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TUBB3Q13509 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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TUBB3Q13509 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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TUBB3Q13509 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TUBB3Q13509 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
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TUBB3Q13509 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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TUBB3Q13509 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUBB3Q13509 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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