Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TOP3AQ13472 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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