Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
LSAMPQ13449 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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