Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RESTQ13127 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RESTQ13127 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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