Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RESTQ13127 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RESTQ13127 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RESTQ13127 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RESTQ13127 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RESTQ13127 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RESTQ13127 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RESTQ13127 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RESTQ13127 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RESTQ13127 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.7 ms