Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
MRPL28Q13084 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
MRPL28Q13084 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
MRPL28Q13084 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
MRPL28Q13084 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
MRPL28Q13084 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
MRPL28Q13084 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
MRPL28Q13084 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
MRPL28Q13084 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
MRPL28Q13084 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
MRPL28Q13084 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
MRPL28Q13084 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
MRPL28Q13084 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
MRPL28Q13084 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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