Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GRIK2Q13002 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIK2Q13002 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232 ms