Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.6 ms