Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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HOXD10P28358 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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HOXD10P28358 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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HOXD10P28358 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD10P28358 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
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