Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTIFO43310 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTIFO43310 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTIFO43310 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTIFO43310 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTIFO43310 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTIFO43310 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTIFO43310 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTIFO43310 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTIFO43310 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CTIFO43310 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTIFO43310 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTIFO43310 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTIFO43310 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTIFO43310 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTIFO43310 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTIFO43310 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CTIFO43310 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
CTIFO43310 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTIFO43310 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTIFO43310 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTIFO43310 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTIFO43310 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTIFO43310 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTIFO43310 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTIFO43310 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTIFO43310 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CTIFO43310 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CTIFO43310 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTIFO43310 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTIFO43310 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CTIFO43310 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTIFO43310 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTIFO43310 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTIFO43310 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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