Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3KRW8 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3KRW8 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3KRW8 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3KRW8 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3KRW8 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3KRW8 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3KRW8 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3KRW8 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3KRW8 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3KRW8 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3KRW8 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3KRW8 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3KRW8 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3KRW8 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
J3KRW8 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
J3KRW8 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
J3KRW8 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
J3KRW8 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
J3KRW8 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
J3KRW8 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
J3KRW8 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
J3KRW8 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
J3KRW8 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
J3KRW8 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
J3KRW8 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
J3KRW8 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0□□□□□ -2.41
J3KRW8 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0□□□□□ -2.41
J3KRW8 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0□□□□□ -2.41
J3KRW8 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0□□□□□ -2.41
J3KRW8 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
J3KRW8 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
J3KRW8 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
J3KRW8 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
J3KRW8 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
J3KRW8 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
J3KRW8 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
J3KRW8 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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