Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SOBPA7XYQ1 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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