Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CIPCQ9C0C6 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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CIPCQ9C0C6 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CIPCQ9C0C6 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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