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Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3
NICN1, Nicolin-1, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
NICN1
Q9BSH3
AC079466.2-201
ENST00000585394
185 nt
TSL 5
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
SNORA25.18-201
ENST00000607153
114 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
MIR103A1-201
ENST00000362165
78 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.188-201
ENST00000363952
111 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.337-201
ENST00000365312
102 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
VTRNA1-3-201
ENST00000365645
89 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
SNORA72.6-201
ENST00000384520
129 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6ATAC23P-201
ENST00000408448
123 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6-1086P-201
ENST00000410930
100 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU7-113P-201
ENST00000459273
62 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
MIR1270-201
ENST00000459320
83 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
SNORA31.14-201
ENST00000516728
116 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU7-35P-201
ENST00000517174
62 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
MIR1273G-201
ENST00000577677
100 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
uc_338.16-201
ENST00000621804
95 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
MIR6844-201
ENST00000637122
62 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU4-84P-201
ENST00000364200
139 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6-690P-201
ENST00000365242
106 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6-291P-201
ENST00000384720
107 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.567-201
ENST00000384736
106 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
SNORA75.5-201
ENST00000391291
81 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.651-201
ENST00000459380
103 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6-240P-201
ENST00000516098
97 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
SNORA25.12-201
ENST00000516202
82 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU7-121P-201
ENST00000516604
62 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNA5SP33-201
ENST00000516687
98 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6-861P-201
ENST00000516745
106 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
AL359881.1-201
ENST00000602916
267 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
SNORD115-2-201
ENST00000362842
82 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
SNORD44.1-201
ENST00000363202
61 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6-682P-201
ENST00000363843
106 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
SNORD115-20-201
ENST00000365099
82 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.366-201
ENST00000365540
102 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
SNORA8.2-201
ENST00000384372
139 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.515-201
ENST00000384535
112 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
MIR518A1-201
ENST00000385068
85 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
TRAJ1-201
ENST00000390536
62 nt
APPRIS P1
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6-239P-201
ENST00000390990
99 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
SNORA40.8-201
ENST00000411034
126 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
AC074198.2-201
ENST00000508153
258 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6-138P-201
ENST00000515952
107 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.686-201
ENST00000516548
134 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
AP003327.1-201
ENST00000529684
127 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
MIR4305-201
ENST00000583252
102 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
MIR548AE2-201
ENST00000583456
67 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
AC072026.1-201
ENST00000605023
201 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
CALCRL-202
ENST00000409998
5223 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.205-201
ENST00000364128
113 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNA5SP245-201
ENST00000364239
121 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.240-201
ENST00000364469
95 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6-309P-201
ENST00000364573
106 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
AL022718.1-201
ENST00000412004
84 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6-893P-201
ENST00000458841
100 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNA5SP134-201
ENST00000516492
96 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6-531P-201
ENST00000516694
104 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
RNU6-765P-201
ENST00000516916
99 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
AP002392.1-201
ENST00000537692
208 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
FAM13A-AS1_1.1-201
ENST00000612555
119 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
MIR6779-201
ENST00000617283
64 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
AC108866.1-201
ENST00000503073
2339 nt
TSL 5
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
NICN1
Q9BSH3
SNORD118-201
ENST00000363593
134 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.251-201
ENST00000364551
99 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.357-201
ENST00000365487
109 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.531-201
ENST00000384589
121 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.536-201
ENST00000384621
113 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
SNORD67.1-201
ENST00000516618
108 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
RNU7-137P-201
ENST00000516788
62 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
MIR924-201
ENST00000638017
53 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
RNA5SP133-201
ENST00000363368
119 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
RNU6-200P-201
ENST00000364743
107 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.401-201
ENST00000383965
117 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
RNU6-535P-201
ENST00000384722
107 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
RNA5SP193-201
ENST00000410353
107 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
RNU7-123P-201
ENST00000515911
60 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
SNORA62.5-201
ENST00000516634
120 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
MIR3646-201
ENST00000578301
84 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
AC021443.1-201
ENST00000604478
211 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
AC105081.1-201
ENST00000617727
106 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
U6.109-201
ENST00000636749
87 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
MT-TG-201
ENST00000387429
68 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
SNORD37.2-201
ENST00000391075
66 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
SUMO1P3-201
ENST00000439961
304 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
SNRPGP12-201
ENST00000449481
213 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
RNU7-120P-201
ENST00000459334
63 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.697-201
ENST00000516776
113 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
AC138749.4-201
ENST00000563970
127 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
AC138907.4-201
ENST00000570107
226 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
DNAJC19P2-201
ENST00000593340
302 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
AC108081.1-201
ENST00000604358
221 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
AC011603.4-201
ENST00000611325
277 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
SNORA63.5-201
ENST00000363548
123 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.441-201
ENST00000384123
112 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.552-201
ENST00000384665
112 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
Y_RNA.584-201
ENST00000391090
114 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
RNU7-164P-201
ENST00000459221
62 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
AC108740.1-201
ENST00000498629
225 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
RNA5SP268-201
ENST00000516828
124 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
DEFB131E-201
ENST00000532329
154 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
AC022523.2-201
ENST00000561045
150 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
NICN1
Q9BSH3
AC090625.1-201
ENST00000357130
210 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
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