Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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