Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RPUSD4Q96CM3 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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