Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms