Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP13-3Q3SY46 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms