Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
RTL8BQ17RB0 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
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RTL8BQ17RB0 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
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RTL8BQ17RB0 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
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RTL8BQ17RB0 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
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RTL8BQ17RB0 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
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