Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM187BQ17R55 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FAM187BQ17R55 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms