Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FXNQ16595 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
FXNQ16595 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FXNQ16595 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FXNQ16595 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FXNQ16595 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
FXNQ16595 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FXNQ16595 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FXNQ16595 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FXNQ16595 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FXNQ16595 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FXNQ16595 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FXNQ16595 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FXNQ16595 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FXNQ16595 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FXNQ16595 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FXNQ16595 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FXNQ16595 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FXNQ16595 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FXNQ16595 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FXNQ16595 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FXNQ16595 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FXNQ16595 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FXNQ16595 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
FXNQ16595 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FXNQ16595 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FXNQ16595 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FXNQ16595 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FXNQ16595 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FXNQ16595 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
FXNQ16595 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FXNQ16595 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FXNQ16595 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FXNQ16595 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FXNQ16595 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FXNQ16595 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FXNQ16595 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FXNQ16595 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FXNQ16595 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FXNQ16595 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FXNQ16595 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FXNQ16595 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FXNQ16595 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FXNQ16595 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FXNQ16595 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FXNQ16595 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FXNQ16595 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
FXNQ16595 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
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FXNQ16595 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FXNQ16595 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
FXNQ16595 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FXNQ16595 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FXNQ16595 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FXNQ16595 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FXNQ16595 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
FXNQ16595 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FXNQ16595 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
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