Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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