Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX2Q16385 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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SSX2Q16385 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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SSX2Q16385 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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