Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
USF2Q15853 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
USF2Q15853 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
USF2Q15853 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
USF2Q15853 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
USF2Q15853 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
USF2Q15853 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
USF2Q15853 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
USF2Q15853 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
USF2Q15853 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
USF2Q15853 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
USF2Q15853 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
USF2Q15853 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
USF2Q15853 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
USF2Q15853 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
USF2Q15853 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
USF2Q15853 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
USF2Q15853 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
USF2Q15853 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
USF2Q15853 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
USF2Q15853 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
USF2Q15853 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
USF2Q15853 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
USF2Q15853 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
USF2Q15853 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
USF2Q15853 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
USF2Q15853 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
USF2Q15853 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
USF2Q15853 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
USF2Q15853 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
USF2Q15853 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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