Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SURF1Q15526 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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