Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIV2LQ15477 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SKIV2LQ15477 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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