Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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SEC23AQ15436 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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