Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.18□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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