Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NKX1-1Q15270 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NKX1-1Q15270 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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