Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
MLC1Q15049 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MLC1Q15049 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MLC1Q15049 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MLC1Q15049 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MLC1Q15049 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MLC1Q15049 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MLC1Q15049 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MLC1Q15049 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MLC1Q15049 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.3 ms