Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC3Q15034 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERC3Q15034 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC3Q15034 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.1 ms