Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.34
HERPUD1Q15011 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.37□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERPUD1Q15011 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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