Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PCLAFQ15004 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PCLAFQ15004 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PCLAFQ15004 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203 ms