Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCAPHQ15003 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCAPHQ15003 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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