Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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GPNMBQ14956 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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GPNMBQ14956 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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GPNMBQ14956 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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GPNMBQ14956 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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GPNMBQ14956 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPNMBQ14956 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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