Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAPRIN1Q14444 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.6 ms