Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
APOFQ13790 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
APOFQ13790 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
APOFQ13790 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
APOFQ13790 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
APOFQ13790 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
APOFQ13790 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
APOFQ13790 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
APOFQ13790 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
APOFQ13790 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
APOFQ13790 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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APOFQ13790 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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APOFQ13790 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
APOFQ13790 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
APOFQ13790 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
APOFQ13790 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
APOFQ13790 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
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APOFQ13790 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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APOFQ13790 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
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APOFQ13790 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
APOFQ13790 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
APOFQ13790 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
APOFQ13790 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
APOFQ13790 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
APOFQ13790 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
APOFQ13790 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
APOFQ13790 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
APOFQ13790 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
APOFQ13790 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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