Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTCH1Q13635 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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PTCH1Q13635 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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PTCH1Q13635 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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PTCH1Q13635 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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PTCH1Q13635 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTCH1Q13635 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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