Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TCIRG1Q13488 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCIRG1Q13488 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.3 ms