Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC2Q13487 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC2Q13487 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms