Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LSAMPQ13449 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LSAMPQ13449 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms