Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFT88Q13099 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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IFT88Q13099 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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IFT88Q13099 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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IFT88Q13099 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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IFT88Q13099 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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IFT88Q13099 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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