Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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CHD3Q12873 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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CHD3Q12873 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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CHD3Q12873 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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CHD3Q12873 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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CHD3Q12873 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
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CHD3Q12873 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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CHD3Q12873 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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