Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATRXP46100 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATRXP46100 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRXP46100 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRXP46100 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRXP46100 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRXP46100 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRXP46100 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRXP46100 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRXP46100 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRXP46100 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRXP46100 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRXP46100 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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