Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HOXD13P35453 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD13P35453 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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