Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD9P28356 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXD9P28356 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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