Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CRXO43186 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CRXO43186 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CRXO43186 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CRXO43186 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CRXO43186 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CRXO43186 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CRXO43186 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CRXO43186 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CRXO43186 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CRXO43186 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CRXO43186 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CRXO43186 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CRXO43186 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CRXO43186 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CRXO43186 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CRXO43186 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CRXO43186 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CRXO43186 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CRXO43186 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CRXO43186 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CRXO43186 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CRXO43186 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CRXO43186 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CRXO43186 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CRXO43186 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms